来源 :贝瑞基因2022-06-20
近日,由贝瑞基因提供技术支持的三代CAH(先天性肾上腺皮质增生症)临床回顾性研究成果在检验医学领域权威国际学术期刊Clinical Chemistry(即时IF=11.784)上发表,这是运用分子诊断技术探索CAH分子机制的一次创新。该研究证明贝瑞基因三代CAH检测技术与传统MLPA+Sanger+家系组合分析方法或生化分析方法相比,筛查更全面,检测更准确。

图:论文首页截图

本次研究成果由中南大学医学遗传学研究中心与湖南省妇幼保健院联合发表,中南大学医学遗传学研究中心邬玲仟、梁德生教授为这项研究的通讯作者。
先天性肾上腺皮质增生症(Congenital Adrenal Hyperplasia,CAH)是世界上最常见的常染色体隐性遗传病之一,会导致肾上腺皮质功能不全、生殖器模糊或性发育障碍、不孕、身材矮小以及青春期和成年期代谢综合征风险增加等,严重者可致命。
由于疾病严重性,CAH筛查已被纳入卫健委下发的《全国出生缺陷综合防治方案》,是我国新生儿常见筛查疾病病种之一。同时,由于CAH具有高度临床和遗传异质性,对筛查诊断而言是一个巨大的挑战。

传统基于类固醇激素水平的CAH筛查方法(时间分辨荧光分析法TRFIA、液相色谱-串联质谱LC?MS/MS)特异性低,假阳性率高,会增加家长不必要的精神负担。而且无法及时明确疾病根源的致病基因型,造成确诊速度慢或误诊。
作为遗传病诊断的“金标准”,基因检测在CAH筛查上也面临着“真假基因”的挑战。真基因CYP21A2和假基因CYP21A1P基因同源性高达99.8%,即便采用长片段PCR、多重连接探针扩增(MLPA)、序列分析等多种方法联合也难以进行区分,易导致假阴性/阳性结果。
此外,传统的基因检测方法无法精确检测大片段重复基因型,难以对缺失类型进行精确分型,对于不同致病性变异的复合杂合子为顺式还是反式结构还必须进行家系分析,无法一步到位。

三代测序具有单分子实时测序、长读长、无需PCR扩增等优势,贝瑞基因将其应用于CAH筛查,使效率和精度全面提升,在临床应用上远优于传统CAH检测:
●可在同一反应管中同时检测数百种CAH突变;
●可轻松区分传统PCR方法及NGS无法检出的真假基因,精准识别大片段缺失/重复及不同缺失型变异的亚型;
●不依赖于家系分析,直接区分顺/反式变异;
●可通过新生儿干血斑、外周血等样本中的痕量DNA进行三代长读长测序和生物信息分析,不受代谢等其他因素影响,实现对目标基因精准覆盖。
贝瑞基因三代CAH产品可弥补传统CAH检查手段流程繁琐周期长,且无法全面检测所有变异类型等不足,对CAH涉及相关基因的SNV/InDel/CNV、拷贝数异常、假基因、基因重排“一网打尽”。

图:三代CAH的基因变异结果展示

图:三代CAH家系样本检测结果
同时,三代CAH可以缩短病因排查周期,实现筛诊一体,帮助患儿及时确诊与尽早干预,避免家长来回奔波重复采样,实现一种技术一次到位检测所有CAH相关基因变异类型,为CAH筛查诊断及遗传咨询提供了强有力的工具。


图:三代CAH与MLPA+Sanger测序进行比较
值得一提的是,贝瑞基因“同时检测先天性肾上腺皮质增生症(CAH)相关9个基因多种突变的引物组和试剂盒”也已于2022年1月取得发明专利证书。未来,贝瑞基因也将继续瞄准国家重点防控的单基因遗传病,基于三代测序平台开发更多创新检测方法。