公司控股股东为海南机场集团有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。作为海南省最大的国企上市公司平台，公司灵活统筹体制融合与机制创新，既拥有国企规范化管理体系，又兼具本身专业化、市场化优势，不断提升公共服务能力和品质， 强化对外资源拓展和内部资源协同发展,聚焦优势资源实现跨越式高质量发展。
截至2024年7月25日，胡丹锋先生、华铁恒升、大黄蜂控股及公司股东黄建新先生通过协议方式转让给海控产投的无限售流通股275,134,136股股份的相关过户登记手续已办理完毕，并取得了中国证券登记结算有限责任公司出具的《证券过户登记确认书》。本次股份转让完成后，海控产投直接持有上市公司275,134,136股股份，占公司股份总数的13.96%，成为公司第一大股东。公司控股股东变更为海控产投，实际控制人变更为海南省国有资产监督管理委员。
公司控股股东为海口市国有资产经营有限公司，实际控制人为海口市国有资产监督管理委员会。2018年5月17日公司在互动平台披露：针对海南建设自由贸易区的政策，公司专门召开战略规划研讨会，公司将围绕相关政策探索国际贸易与供应链金融、物流和仓储平台等业务，公司充分利用好政策红利，把握本轮改革的大好机会，实现更大更快发展。2023年12月22日公司在互动平台披露：利用自贸港区域和政策优势上，公司将结合主营业务及区域优势，以政策和市场为导向，把握市场机遇，逐步探索建立更加广阔的市场渠道和交易平台的可能性。
公司控股股东为海南省交通投资控股有限公司，实际控制人为海南省人民政府国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南省发展控股有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南海汽投资控股有限公司，实际控制人为海南省国有资产监督管理委员会。
公司控股股东为海南省农垦投资控股集团，实际控制人为海南省人民政府国有资产监督管理委员会。